松材线虫检测仪是一种用于检测松材线虫(Bursaphelenchus xylophilus)存在的设备。松材线虫是一种具有破坏性的植物寄生线虫,可以引起松树(尤其是松科树种)的严重病害,导致松树枯萎和死亡。早期的检测和监测对于及早采取防控措施和减轻疫情的影响至关重要。
检测步骤:
松材线虫检测仪通常基于分子生物学的技术主要包括以下步骤:
样品提取:从疑似感染松树或木材中提取样品。样品可以是树干、树皮、树根、锯木或其他可能存在线虫的植物组织。
核酸提取:使用适当的方法从样品中提取松材线虫的DNA。这是为了获取线虫的遗传信息,以便进行后续的分子检测。
核酸扩增:使用实时定量聚合酶链式反应(qPCR)技术,特异性地扩增松材线虫DNA,从而确定样品中是否存在松材线虫,并定量检测目标DNA序列的起始数量。
仪器基本结构:
松材线虫检测仪是实时检测反应的仪器,主要由基因扩增热循环系统、荧光实时检测系统、微电路控制系统、计算机及应用软件组成。其中两个核心功能模块:热循环系统和荧光实时检测系统。其中基因扩增热循环系统工作原理与传统基因扩增仪工作原理基本相同,采用半导体加热制冷工作方式完成热循环过程。荧光检测系统主要有由荧光激发部件、光信号传输部件、荧光检测部件、控制系统组成。
仪器主要参数:
1.样本容量:16孔;
2.适用耗材:0.2ml单管透明管、8联管;
3.检测通道:≥2;
4.适用荧光素:
1)通道1:FAM、 SYBR Green I、SYTO 9、EvaGreen、LC Green等;
2)通道2:HEX, VIC, TET, JOE等;
3)无需ROX及其他通道校正。
★5.反应体系:5-100μl,支持超小试剂反应体系;
6.光源:高亮长寿命免维护LED光源;
★7.荧光检测方式:新型光电检测器,底部检测专利技术(非顶部、非侧壁),2个荧光通道同时检测,无荧光边缘效应;
★8.检测时长:约5秒内完成2个荧光通道16个孔位的全部检测;
9.模块控温范围:4~99℃;
10.控温技术:进口半导体制冷片加热制冷技术;
11.温度均匀性:≤±0.1℃;
★12.温度速率:
1)**升温速度:≥ 7℃/S
2)**降温速度:≥ 6℃/s;
13.梯度温度:
1)宽度:0
2)温度数:0
★14. 操控方式:
1)内置PC:仪器通过通讯口与内置7寸触摸屏 连接后,利用电脑上的应用软件实现实验设置、运行监控、数据分析等操作;
15.热盖自动压力调节:样本管放入后,自动热盖压力自适应。
★16.软件分析功能:定性分析、绝对定量分析、相对定量分析、终点荧光分析、熔解曲线分析等;
★17.报告功能:可导出PDF等格式,可数据上传服务器(选配);
★18.报告自定义功能:预存实验模板,可选择打印机(选配),直接打印结果;
★19.实验数据在仪器内实时保存;
★20.内置多个用户模板方便操作。
附【使用指南】
1.样品处理与核酸提取
1.1 样品处理
1.1.1虫悬液样本:已经分离出的虫悬液样本可直接编号待检。
根据待检样品数量, 取相应数量的 1.5 mL 离心管分别加入混匀后的虫悬液 1 mL,1,0000 rpm 离心 1分钟,弃去上清。然后加入 100 μL 核酸快提液,涡旋(2-3秒)混匀后,进行下一步实验。
1.1.2疫木样本:用电钻钻取疫木木屑,编号待检。
根据待检样品数量,取相应数量的 1.5 mL 离心管分别加入钻出的疫木木屑 100mg左右(至离心管0.5刻度度线位置) ,同时加入 1mL 核酸快提液,充分涡旋(2-3秒)混匀,10,000 rpm 离心 30秒, 进行下一步实验。
1.2核酸的提取
将上一步处理好的样品,95℃ 温育5 分钟,涡旋(2-3秒)瞬时离心(4-5秒)后,所得溶液即为待检核酸。如在两小时检测可以把待检核酸存放于 4 ℃,否则请于 -20℃ 下储存。
2.核酸扩增
2.1 打开松材线虫检测用荧光定量PCR仪,启动应用程序待用,取出PCR反应液管,PCR反应复溶液和阴、阳性对照涡旋(2-3秒)混匀,瞬时离心(4-5秒)待用。
2.2 剪取 n 个冻干反应管(n=样品数+1 阳性对照+1 阴性对照),在每个反应管中加入 20 μL PCR反应复溶液,然后按顺序分别加入阴性对照 5 μL,待检模板 5 μL,阳性对照 5 μL,每管所得反应总体积为 25 μL,轻弹冻干反应管管底,以保证冻干颗粒完全复溶,瞬时离心(4-5秒)。
2.3 将准备好的PCR反应管放入仪器内,设置所需要的的孔位,使用仪器以下程序,点击实验开始按钮,开始。
步骤 |
程序 |
循环数 |
1 |
37℃ 5min |
1 |
2 |
95℃3min |
1 |
3 |
95℃10s |
40 |
58℃ 20s(采集荧光) |
3.结果判读
根据分析后的图像调整基线和阈值。阈值设定原则以阈值线超过正常阴性对照品的**点及线性**为准,在阈值以上的荧光曲线应当是具有明显的S型曲线。阳性对照Ct值应小于30,阴性对照Ct值无数据,否则该次实验视为无效,应检查仪器、试剂、扩增条件等方面的误差。
① 检测样本Ct值≤ 36.0者判为阳性;
② 检测样本Ct值﹥36.0者或无Ct值者判为阴性。
若阴阳性对照反应管结果与上述情况不符,则本次检测结果无效,应重新检测或与产品技术支持联系。